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샷건 메타지놈 분석
Shotgun Metagenome Analysis
샷건 메타지놈 분석은
더 많은 유전자 데이터를 이용하여
마이크로바이옴 심층연구 솔루션을 제공합니다.
16S rRNA gene만 이용하는 MTP 서비스와 달리 샘플을 구성하는 미생물의 유전자 전체를 분석하는 서비스입니다. 1,492개 종(species)의 Complete genome 으로 연구된 Bacterial core gene (UBCG)과 KEGG DB를 이용하여 더욱 정확한 미생물 군집 분석(Taxonomic profiling)과 기능유전자(functional profiling) 분석결과를 함께 제공합니다.
UBCG Reference 논문
Na, S. I., Kim, Y. O., Yoon, S. H., Ha, S. M., Baek, I. & Chun, J. (2018). UBCG: Up-to-date bacterial core gene set and pipeline for phylogenomic tree reconstruction. J Microbiol 56.
Shotgun-Metagenome과 16S-based MTP 비교
Shotgun Metagenome 16S-based MTP
Target gene 전체 유전자 16S rRNA
Taxonomic Profile 92 core genes 기반 분석 (UBCG)
EzBioCloud Genome DB 사용		 16S rRNA 기반 분석
EzBioCloud 16S DB 사용
Functional Profile 실제 유전자를 시퀀싱&분석 미생물군집조성을 바탕으로 유전자 예측 분석
Features 가장 정확한 종(species) 수준의 분석
기능유전자 분석 동시에 진행 가능
Human microbiome 연구에 최적화		 Public data가 많아 비교분석 가능
다양성이 높은 환경 샘플에도 적용 가능
더욱 정확한 미생물 군집분석과
실제 유전자 데이터를 이용한
Functional profile 분석으로 미생물의
기능적인 역할까지 확인 가능합니다.
  • Taxonomic profile
  • Functional profile
  • Comparative analysis
  • Antimicrobial Resistance Genes (항생제 내성 유전자 정보)
  • Virulence Factor (독성인자 정보)
예시 리포트 보러가기
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샷건 메타지놈 분석 결과는
개별 샘플의 Taxonomic, Functional profiling
92개 core gene (UBCG)를 이용한 완전한 종 수준의 정확한 taxonomic profiling과 KEGG DB를 이용한 metabolic pathway 관점에서의 functional profiling 제공
그룹간 비교분석으로 Taxonomic, Functional gene biomarker 확인
연구내용에 따라 여러 샘플들의 그룹을 설정하고, 그룹간 비교분석으로 taxonomic, functional gene biomarker를 찾아내어 계통 및 기능적 차이를 확인
항생제 내성 및 독성인자 분석
Anti-microbial resistance 와 virulence factor 전용 DB를 이용하여 항생제 내성 및 독성인자 관련 유전자 profiling 제공

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